2020年新年伊始，一場可怕的傳染病，新型冠狀病毒肺炎肆虐湖北，尤以武漢疫情最重。直到武漢封城，啟動突發公共衛生事件一級響應，讓全國人民意識到事態嚴重，黨中央、國務院迅速做出一系列戰略部署，為阻擊疫情、救治病人贏得了寶貴的時間，也為打贏這場戰役奠定了堅實的基礎。
1月26日，甘肅省中醫院發出了支援武漢的倡議，姚雙吉第一個報名參加。就像2009年的玉樹抗震救災一樣，他主動請纓，第一時間到達現場，經受住了高原、高寒、缺氧的嚴峻考驗，圓滿完成了任務。作為此次馳援武漢醫療隊里的最年長者之一，姚雙吉沒有考慮個人安危。他說：“人民有難，匹夫有責，雖然我年齡偏大，但我比年輕人經驗更豐富一些。”的確，從家里情況來說，姚雙吉也有一定的困難，他的家里有年過八旬的父母，剛做完手術10多天，身體未康復的愛人，都需要他的照顧，而這些只能交給尚年幼的姑娘，姚雙吉跟隨第一批援鄂醫療隊踏上了支援武漢抗疫的征程。
1月29日夜，姚雙吉和隊員們進駐武漢中心醫院后湖分院，開始收住新冠肺炎病人，由于初來乍到，加之非常時期，方方面面的困難擺在他們面前。因為病房都是普通病房臨時征用，消毒隔離面臨很大的難題，只能一邊收治病人，一邊做院感防控。姚雙吉和隊員們采取8到10小時輪班，穿上像鎧甲似的防護服，長時間不能吃不能喝，不能方便。汗水浸透了衣衫，一個班次下來，都有快虛脫的感覺。但只要聽到病人一句感謝，“感謝遠道而來的甘肅好人！”姚雙吉覺得自己的辛苦都值了。高強度的工作對姚雙吉的身體也是極大的考驗，但他說：“我必須努力堅持，做好年輕同志的表率，做好他們的心理工作，叮囑防護好每一個細節，保持團隊強有力的戰斗力，尤其看著尚一臉稚氣和自己孩子差不多一樣大的同事，自己也覺得壓力很大，我必須保證每一位隊員的生活、工作安全，做好心理疏導，保質保量完成任務。”
經過幾天的努力，中心醫院的工作慢慢步入正軌，可是另一病區的福建醫療隊要支援其他地方，病區病人要交給姚雙吉這一區，這樣一來，姚雙吉和隊員們就要管理兩個病區的病人，壓力陡增，班次輪流更頻繁了，而且狀況層出不窮。2月8日，姚雙吉接到通知，甘肅醫療隊要抽調重癥醫學專業10名醫師，20名護士迅速增援武漢協和醫院。當即決定由姚雙吉帶領重癥組隊員開拔協和醫院，救治危重癥患者。在協和醫院，不到三天，姚雙吉和隊員們就迅速收治了800余名病人，且病人大部分為重癥、危重癥。工作強度、壓力更大了，病區無創、插管有創通氣的病人也多。隊員們分成兩組迅速進駐住院部9樓、13樓，與協和醫院醫護、廣州醫療隊護士組共同組成醫療組，開始危重癥患者的救治工作。
在協和醫院，姚雙吉白班夜班連軸轉，一個插管上呼吸機的病人比治療10個普通病人的強度都要大，甚至忙得忘記了今天是幾號、星期幾，只知道夜以繼日地救治病人。太累的時候，姚雙吉只得隨便找個地方打個盹，吃飯也沒個點，餓極了隨便找一點吃的東西。即便如此，姚雙吉的團隊沒有一個人退縮，沒有一個人有怨言，沒有一個人喊困難，
在完成繁重的臨床值班、查房任務之外，姚雙吉還兼任協和醫院戰時醫務處成員、戰時醫院疑難危重癥、死亡病例討論專家組成員、醫院中醫藥治療專家組成員。參加每周兩次的疑難病例討論，每周兩次的死亡病例討論，每周兩次的醫療質量控制督查。病人的中醫辨證遣方用藥。繁重的工作，體力的透支，作為組長，姚雙吉不能也不敢表現出來，以免影響大家的心情，削弱團隊戰斗力。不過工作中也有讓人欣慰的地方，姚雙吉的病區有個病人陳先生，是一個很健談的人，他告訴姚雙吉，“我印象當中你們甘肅比較窮，可是在這個時候你能逆流而上，每天那么累，我們武漢人民感謝你們，誰以后在武漢欺負甘肅人，我第一個不答應。”出院病人的一聲聲感謝，都在激勵著姚雙吉和隊員們。在姚雙吉和隊員們的心中，只要“醫”心移“疫”，眾志成城，就一定能戰勝疫情。